《圣斗士星矢：黄道十二宫战士》每集将有30分钟左右的时长，并将一次性播出完毕。故事内容则包含“银河战争篇”以及“白银圣斗士篇”。

射手座黄金圣斗士艾欧洛斯怀抱女神转世雅典娜逃出圣域，途中遭到双子座撒卡和摩羯座修拉的阻击身负重伤。命运的驱使下，垂危一线的艾欧洛斯将女神托付给刚好来喜马拉雅山脉探险的日本城户财团总裁城户光政。知晓前因后果的光政将女神带回日本，并为之起名沙织，以孙女的名义将其抚养长大。

在遥远的神话时代，海中的波塞冬、冥界的哈迪斯无一不在觊觎人类赖以生存的大地。身为大地守护神的雅典娜，与他们展开连番战争。与此同时，人类中一些骁勇善战、正义善良的少年围绕在女神身边和她并肩作战。他们拳可以撕裂天空，脚能够踩裂大地，这群不用武器、完全凭借赤手空拳战斗的少年被称作“雅典娜的圣斗士”。从神话时代开始，雅典娜和圣…

故事讲述243年前,刚从青铜圣斗士上升为黄金圣斗士的年轻的童虎和史昂二人,得知冥王今世选中的肉体所在的地方,于是决定私自行动.

故事终于进入了传说中的“圣域十二宫篇”！！！星矢和青铜圣斗士们为了拯救女神雅典娜，直面教皇率领的黄金圣斗士们，双方演绎出一场惊世大战！

当世界遍布邪恶之时，必定会出现希望的斗士—圣斗士。很久以前，由数位少年来保护雅典娜女神，他们被称为“雅典娜的圣斗士”，用他们的身体作为武器，他们的拳头能划破长空，他们的腿能把大地分割开。而现在，拥有信念、勇气和力量的少年们，以新的圣斗士姿态重生！70后与80后乃至90后的人们，都曾经被车田正美这部代表作品中热血与牺牲所触动。…

16年前，射手座黄金圣斗士艾欧洛斯怀抱真正的女神转世雅典娜逃出圣域，途中遭到双子座撒卡和摩羯座修拉的阻击身负重伤命运的趋势下，垂危一线的艾欧洛斯将女神托付给刚好来喜马拉雅山脉探险的日本城户财团总裁城户光政（大杉涟配音）知晓前因后果的光政将女神带回日本，并为之起名沙织，以孙女的名义将其抚养长大接受命运和女神的感召，经过艰苦…

与冥王哈迪斯惨烈战斗终于结束，世界再次回到光明之中但对于圣斗士来说，却伤亡何其惨重黄金圣斗士全部阵亡，星矢虽然在最后的决战中侥幸逃生，却落得五感尽失，形同废人然而，这来之不易的和平却无法持续太久，在经历了撒加叛乱、海神波塞冬、冥王哈迪斯等危机之后，另一支邪恶之手也向人类世界伸来。这便是太阳神阿波罗——女神雅典娜的哥哥。…

神话时代，宙斯之子亚伯妄想统治大地，他自称太阳神，张扬跋扈不可一世，最终遭到宙斯和阿波罗的抹杀数千年后，亚伯复活，假上天之名欲淹没人类文明，重建众神世界他邀请雅典娜和其共同统领世界，并用神力复活战死的黄金圣斗士假意合作的雅典娜试图暗杀亚伯，反被其所害。星矢、紫龙、冰河等人来至太阳神殿，遭遇日晷战士和黄金圣斗士的伏击，少…