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一颗流星划过东京夜空，随它一同到来的还有希腊神话传说中的黄金苹果善良的孤儿院女老师绘梨衣与孩子们过着平静的生活，但是她受到黄金苹果的召唤，化身为纠纷女神艾莉丝为了实现毁灭世界的目的，她绑架了女神雅典娜，并用金苹果将其捆住随同纠纷女神一同复活的还有矢座魔矢、竖琴座奥菲斯、南十字星古拉特、神盾座阿恩、奥利安座渣加等五位亡灵… -
不祥之夜，四道邪恶光芒侵入圣域，以迅雷不及掩耳的速度击倒多名黄金圣斗士来者乃圣魔天使，是堕落天使路西法的手下神话时代，路西法试图凌驾众神之上，最终被打入魔界他怀着恐怖罪恶的念头复活，凭借堕入魔界的波塞冬、艾丽丝、阿波罗小宇宙的支持，路西法在世界各地掀起连番灾难，人类命运危在旦夕。为了拯救人类，纱织小姐情愿献出圣血。面对…
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遥远的东西伯利亚，北风呼啸，暴雪横飞，这个冬季变得格外漫长，不祥的气息在空气中肆意弥漫正在此地修炼的冰河，偶然救助一个被人追杀的男子从他的口中，冰河得知北欧的神之大陆发生巨大变故，神与神的战争一触即发在此之后，冰河神秘失踪，纱织小姐带领星矢等人拜访了神之大陆的教主多路巴，然而对方顾左右而言它，神域之行一无所获。多路巴阴…
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战场移到黑暗的冥界，一场绵亘了数千年的正邪大战就此展开……在遥远的神话时代，冥王哈迪斯曾率领108冥斗士向人类世界发起攻击，智慧女神雅典娜则率圣斗士们奋起迎敌连番苦战之后，哈迪斯及其军团战败，他们全部被雅典娜封印，而圣斗士也几乎损伤殆尽。数千年后，女神的封印失去效力，古塔中的冥斗士又重新蠢蠢欲动。复活后的哈迪斯及其冥斗士…
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本动画是《圣斗士星矢》30周年纪念作。与冥王哈迪斯战斗时，为给星矢他们打开突破口，12位黄金圣斗士舍命破坏了叹息之墙！然而，已逝的艾欧利亚和其他黄金圣斗士却在阳光普照的美丽大地上复活！2015年，黄金小宇宙终于苏醒！
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极乐净土篇讲的主要是星矢等人在通过叹息之墙后，到达极乐净土的故事 极乐净土据说是只有生前心灵纯洁的人，在死后才能到达的地方。冥王哈迪斯的真身便藏在此处，雅典娜也被困于此。在极乐净土篇中星矢等人将再次创造奇迹，救出雅典娜，粉碎哈迪斯妄图将人间变为地狱的阴谋在此篇中，冥王的左右手死神和睡神将会露面。
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在遥远的神话时代，冥王哈迪斯曾率领108冥斗士向人类世界发起攻击，智慧女神雅典娜则率圣斗士们奋起迎敌。连番苦战之后，哈迪斯及其军团战败，他们全部被雅典娜封印，而圣斗士也几乎损伤殆尽。数千年后，女神的封印失去效力，古塔中的冥斗士又重新蠢蠢欲动。复活后的哈迪斯及其冥斗士将魔爪伸向圣域。连番恶战，圣域几近毁灭。参透阿赖耶识的处…