小新创造的漫画猪——不理不理左卫门，竟然被一个科学家看中，而这个科学家竟然被恐怖组织猪脚子抓去，于是不理不理左卫门被研发成了破坏全世界的超级病毒。维护世界和平组织sml知道了这个消息，派出特工前往偷取资料，没想到被发现，负伤之下竟然撞进了小新幼儿园的游船，于是小新他们一起被抓到了猪脚子总部。后来在小新的劝说下，小猪竟然决…

某一晚，野原一家同时梦见了古装剧里才会出现的“古代美女”，虽然全家人都觉得很不可思议，却也没有深入追究。当天下午小新从幼稚园回来时，看到小白正在庭院里拼命挖洞，而当小新也跟着开始挖掘后，竟然挖出了一个箱子，里面放有小新亲笔写的书函，除了写有天正2年的字眼外，还画有肥嘟嘟左卫门的图案。小新由于摸不着头绪而闭上眼睛思考，却…

未来人歇鲁跑到日本的战国时代改变了历史，时空巡逻队铃可发现了异状，正预备前往，没想到在时光隧道中遭受到攻击，不小心掉进二十世纪的小新家。铃可借由小白向野原一家求救，于是野原一家踏上时光之旅回到战国时代。遇见了吹雪丸的他们，一同前往云黑城，打倒化身为云黑斋改变历史的坏蛋歇鲁，没想到的是歇鲁居然躲过攻击，还逃到了二十世纪。…

向日葵幼稚园带着所有的小朋友到新开幕的奇异乐园玩，只是小新后来居然没跟着大家走，独自走进了尚未对外开张的马戏团，在这里遇到了童话故事中的木偶多佩玛。坏人们为了争取超级无敌厉害的扑克牌，展开了一场现实与魔幻世界的追逐，最后连小新的爸爸妈妈都被双魔的手下抓走了，为了救回爸爸妈妈，小新只有勇敢的再回到奇异乐园…...

小新的妈妈美冴时来运转，竟然抽中了特等奖——全家到美丽的布里布里岛国免费6日游！于是，爸爸、妈妈和小新收拾好东西出发了！谁料，旅程中小新竟然遭人绑架了！原来布里布里国的黄金之都埋藏着神奇的宝藏，当地野心勃勃的白蛇党领袖蟒蛇伯爵妄图掠夺宝藏，而打开黄金之都的钥匙就是布里布里国的森凯诺王子。巧合的是，森凯诺王子和小新长得一…

春日部突然有人举办了“20世纪博览会”，大人们都沉浸在旧时的电视节目和电影、日常生活里，不过小新等小孩子们感到趣味索然。当大人们从博览会回来后，每个人都开始变得懒散，不仅不再做家事，也不再到公司里去上班，每天只知沉迷在旧时的电视节目或是玩耍里，并且开始对小新等小孩子们视若无睹。有一天突然出现几辆卡车，把所有大人载走，只留…

一天早晨，小新一家人正为了晚上的烧肉大餐而兴奋至极，却被一名突然闯入的男子打乱了一切，自此原本过着安逸生活的一家人竟成了通缉要犯，还被神秘组织“甜蜜男孩”追讨一项没有人知道是什么的“那个东西”！为了能如原订计划吃到超豪华烧肉大餐，一家人把时间限定在晚餐前，发誓要在这之前找出真相，洗刷冤屈！

小新在河边无意间捡到一颗弹珠，看它很闪亮于是就带回了家里，没想到却被小葵吞进肚子里。这下糟了，原来这颗弹珠是珠由良族与珠黄泉族在争夺的魔人贾克的珠子，珠黄泉族的首领玉王想要利用贾克的魔力征服世界。就这样，小新一家人卷入两族人的争夺战中，小葵被玉王绑架了。大家为了保护小葵，费尽心力。但最后平安的救出了小葵，小新却在无意间…

小新一家还有风间、妮妮、正男和阿呆一起报名动感超人周年纪念南海之旅。就在动感超人电影的船上首映会上，突然出现了一群粗暴的猴子将大人们都掳走了。春日部防卫队为了救出大人们而出动，小新一行人冒险渡海到南海上的一座荒岛希望可以查出发生了什么事，但本应在船上的小葵和小白竟突然出现，小新还发现另一辆古怪的船......

小新与朋友们在公园玩耍，一名神秘女子，自称是小新未来的新娘，因为受到长大后的小新所托付，要带小新到未来去。风间等人觉得女子很可疑，为了救小新也跟到未来去。在未来，地球被巨大陨石群撞上，天空一片黑暗。长大后的小新，看到世界一片黑暗，决心要让世界变得更明亮，但只靠他一人的力量并不足够。于是，一场紧张刺激的冒险就此展开。