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宇宙世纪0074年，爱德华以夏亚·阿兹纳布的身份进入吉恩自治共和国国防军官学校学习。在那里，他与来自SIDE3的名门子弟互相赏识，成为模拟好友。宇宙世纪0077年，学生们揭竿而起，发起了针对地球联邦军的武装起义。对夏亚来说，他的复仇也由此拉开序幕…
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《机动战士高达 THE ORIGIN》系列的第6作。继续讲述了因父亡故而变成孤儿的卡斯巴尔与阿尔黛西亚，在动荡大时代的洪流之中，面临的又一场人生巨变……标题中的“赤色彗星”便是夏亚·阿兹纳布尔的称号。由于夏亚的机体无论是扎古、大魔，还是后来的沙扎比等都是红色的，夏亚操纵这些机体风骚地驰骋在战场上，故被敌人称作“赤色彗星”。
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宇宙世纪0079年，SIDE-3的吉翁公国对地球联邦发动了战争，在吉翁新兵器的威力下，联邦军毫无招架之力，于是决定秘密开发新兵器“高达”来对抗敌军威胁。
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宇宙世纪0068年，星际旅行成为平常，过度膨胀的人口通过宇宙殖民通往其他星球。太空殖民地环绕地球，构成了不可分割的整体。在此期间，宇宙殖民城市SIDE3——穆佐自治共和国的议长吉翁·什姆·戴肯针对独立于地球联盟政府之外的主题发表慷慨激昂的演说。谁知演说过程中他突然倒地，一命呜呼。在此之后，坚信扎比家族是谋害吉翁的幕后黑手的金巴…
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宇宙世纪0068年，太空殖民地环绕地球，构成了不可分割的整体。在此期间，宇宙殖民城市SIDE3——穆佐自治共和国的议长吉翁·什姆·戴肯针对独立于地球联盟政府之外的主题发表慷慨激昂的演说，谁知演说过程中他突然倒地，一命呜呼。在此之后，坚信扎比家族是谋害吉翁的幕后黑手的金巴·拉尔接近了吉翁的儿子卡斯巴尔·雷姆·戴肯，想尽办法令其避…
