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小新跟妈妈还有风间，妮妮，正男，阿呆一起报名动感超人周年纪念南海之旅，就在动感超人电影的船上首映会上，突然出现了一群粗暴的猴子将大人们都掳走了春日部防卫队为了救出大人们而出动，大家乘坐上水上摩托车，来到了森林里，他们能成功吗？
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未来人歇鲁跑到日本的战国时代改变了历史，时空巡逻队铃可发现了异状，正预备前往，没想到在时光隧道中遭受到攻击，不小心掉进二十世纪的小新家铃可借由小白向野原一家求救，于是野原一家踏上时光之旅回到战国时代遇见了吹雪丸的他们，与他一同前往云黑城，打倒化身为云黑斋改变历史的坏蛋歇鲁，没想到的是歇鲁居然躲过攻击，还逃到了二十世纪原… -
向日葵幼稚园带着所有的幼稚园小朋友到新开幕的奇异乐园玩，只是小新居然在后来没跟着大家走，独自走进了尚未对外开张的马戏团，在这里遇到了童话故事中的木偶多佩玛坏人们为了争取超级无敌厉害的扑克牌，展开了一场现实与魔幻世界的追逐，最后连小新的爸爸妈妈都被双魔的手下抓走了，为了救回爸爸妈妈，小新只有勇敢的再回到奇异乐园…
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小新在河边无意间捡到一颗弹珠，看它很闪亮于是就捡回家里没想到却被小葵吞进肚子里这下糟了，原来这颗弹珠是珠由良族与珠黄泉族在争夺的魔人贾克的珠珠，珠黄泉族的首领玉王想要利用贾克的魔力征服世界就这样，小新一家人卷入两族人的争夺战中，小葵被玉王绑架走了，大家为了保护小葵，费尽心力…最后平安的救出小葵，小新却在无意间，将两颗珠…
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污垢达人正计划将整个地球变成一个大温泉，政府的秘密组织温泉g组为了阻止他们的野心，到处寻找黄金之魂温泉，希望借温泉的神力打倒坏蛋没想到黄金之魂温泉居然就在小新家的地底下，就这样他们一家人卷入了守护温泉的正邪之战.....
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《蜡笔小新:超时空!呼风唤雨之我的新娘》:一个叫多美子的女子突然出现在小新面前，她自称是未来小新的新娘，坐着时间机器穿越时空来到这里 原来，长大后的小新被未来都市"新东京"的支配者金有增藏抓住了，为了救他出来，需要五岁小新的相助。虽然多美子忧心忡忡、着急不已，但小新还是一付神在在的样子。气恼的多美子开始怀疑未来的他…