精灵宝可梦XY1是宝可梦游戏改编电视动画连续剧的第五部，主题是“美丽”，“羁绊”，“进化”，伴随而来的是明显的画质提升、着重针对人物心理的描写和全新的剧情设定。动画主角一如既往是小智和皮卡丘，旅行的搭档则是来自于卡洛斯地方的新伙伴莎莉娜、希特隆和柚丽嘉。

无印篇在日本东京电视台始播于1997年4月1日，结束于2002年11月14日。包含了小智在关都地方、橘子群岛、城都地方的旅行。和小智一同旅行的有自行车被皮卡丘弄坏的小霞；以及原本是尼比市的道馆训练家，立志成为神奇宝贝培育家的小刚。在橘子群岛旅行期间，小刚留在了内木博士的研究所，作为神奇宝贝观察家的小建加入了小智一行。

若叶镇的健太和自己的宠物小精灵们一起进行着修行之旅。旅途中，他遇到了少女真理惠。久别重逢，为了确定彼此的实力，两人展开了一场宠物小精灵比赛。然而，比赛才开始，天空却突然聚集起了雷云，雷鸣也随之轰轰作响。与此同时，专门捕捉宠物小精灵的二人组突然登场，他们驾驶着巨大的机器抓走了许多精灵。正当健太和真理惠与之对抗之时，传说中…

本次的故事发生在全新的冒险舞台——“合众地方”。其蓝本是第五世代游戏（口袋妖怪黑白）。小智与皮卡丘和新伙伴艾莉丝、天桐一起展开为了追寻梦想和冒险以及和各种各样神奇宝贝的邂逅的旅行。

小美和父亲史诺顿博士在绿色原野过着相依为命的生活。某日，博士在偶然之中得到了一块神秘的木刻板，并因此惹祸上身下落不明，留下小美一人过着孤单的生活。小美于无意之中在木刻板上排列的文字，竟然幻化成为了强大的“未知图腾”，为了抚慰小美孤单的心灵，未知图腾制造了美满的幻境令小美深陷其中，随着时间的推移，小美曾经的家被结晶包围，…

《精灵宝可梦XY&Z》是“XY”系列的第三季，故事紧随其后XY2之后，讲述击败了第七道馆的道馆训练家葛吉花后，小智一行人继续以收集齐八枚徽章为目标向映雪市进发。在旅途中，他们遇到了正体不明的绿色生物“小软”（基格尔德·核心）及为其目标而行动的神秘团体“闪焰队”。与此同时，小智和甲贺忍蛙之间发生的神秘联系也逐渐明朗……

传说的宝可梦——凤王在天际翱翔小智与皮卡丘拿着虹色之羽立下誓言——“总有一天，我们会一起去见它！”于是小智，为了成为世界第一的宝可梦大师，和皮卡丘一起展开了旅程。他们在途中遇见训练家诚子以及宗次，并听到了有关凤王的传说。“受到虹色之羽的引导，见到凤王的人，就会成为彩虹勇士。”在不知何时潜入小智影子里的神秘宝可梦——玛夏…

小智与皮卡丘新的冒险开始了！新的冒险舞台是自然资源丰富的阿罗拉地区。在阿罗拉地区这个四处都是蔚蓝的天空和蓝色的大海的地方，等待着小智和皮卡丘的是？新的宝可梦，新的伙伴，以及新的经历。新的冒险旅程终于拉开了帷幕！去吧！全力！大冒险！

还未见过土地上的宠物小精灵，小智想象着与劲敌的战斗。只能与至今一起旅行的小霞、小刚告别，回到故乡真新镇把除皮卡丘外的小精灵全部寄放在大木博士那，决心要去旅行。

小智与皮卡丘新的冒险开始了！新的冒险舞台是自然资源丰富的阿罗拉地区在阿罗拉地区这个四处都是蔚蓝的天空和蓝色的大海的地方，等待着小智和皮卡丘的是？新的精灵宝可梦，新的伙伴，以及新的经历……新的冒险旅程终于拉开了帷幕！