故事时间背景设定为宇宙历6998年（根据吉冈平小说原著中的设定，得知这相当于西元8990年），我们那有点秀逗的主人公Tylor受到“可爱”宇宙军征兵广告的影响来到征兵处。然而让他真正加入宇宙军的原因是……军队这种地方吃饭不要钱；制服和生活日常用品全部都不要钱；又不用担心房钱，要取的各种执照也容易；再加上搭乘宇宙战舰的话，到达敌方以…

宇宙世紀(U.C.)0093年，成為新吉恩總帥的夏亚·阿兹纳布尔對於依然被地球重力所束縛的人類靈魂感到絕望，決心以激烈的手段加以肅正。查知此事的地球聯邦軍王牌駕駛阿姆罗·雷與其所屬的朗德·贝尔艦隊一起與夏亚所領導的新吉恩軍展開最後的決戰...