故事主要描述了德川幕府末期治理江户的将军吉宗的充斥着笑料的日常生活这是一个商人、剑士和农民共存在时代，各种各样性格各异的官宦、豪商、剑客来来往往，表面上看似平凡，可是这里却同时拥有现代化的手机、电脑、摩托车、地铁等现代科技技术充满了现代化气息的明治时代背景，有电视也有摩托车，有现代化的一切家用品……爆笑的剧情立即上演……

第二部的剧情是接再第一部之后发展的，升上小学四年级的一小麻烦魔女们在“最后一次”到魔女世界去的时候，从盛开的花朵中看见了诞生的魔法婴儿因为魔女世界里有一条规定：第一个看到魔法婴儿诞生的魔女就必须当她的母亲照顾她一年。 就因为这个缘故，小麻烦魔女们又回复了魔女见习生的身分，并接受女王陛下的托付，照顾魔法婴儿小花一年。如果…

影片的设定图也一同曝光。本片是为纪念《小魔女DoReMi》推出20周年而推出，由原动画版原班人马制作。