2050年某中游戏风靡了整个世界，让小孩子们沉醉其中LBX（LittleBattlereXperience），这是一种因其性能太过强大而一度中止发售的娱乐用小型机器人可是，LBX的转机还是出现了。强化箱子的出现让情势逆转。这种能够吸收80%冲击力的强化箱子，让LBX的战斗也变得可能，于是LBX改头换面，以纸箱战机的身份再次出现在小孩子们的面前——而在某个极普通…

浑沌支配了大陆──人民畏惧著各种灾害君王们手持著平息浑沌的〈圣印〉守护百姓然而随著岁月流逝，君王们逐渐忘却了守护苍生的理念，为了争夺彼此的圣印和领地，掀起了一波又一波的战争……魔法师希露卡唾弃毫无风骨的各地君王，而浪迹天涯的骑士提欧则是为了解放受苛政所苦的家乡修练武艺

本剧场版紧接TV版第27话在27话良太郎一行人为了追踪异魔神而回到过去，但他们却不知道自己已经落入了牙王的圈套当良太郎等人消灭完异魔神并想回到Den-Liner的时侯，却发现Den-Liner已经被牙王劫持……众人被逼留在过去，最坏的情况是良太郎失去了成为电王的所有记忆，桃泰诺斯也因此不能附上良太郎的身体在机缘巧合下，良太郎遇到10岁时的良太…

2051年，变革者事件结束一年后，在小轨道公司的新LBX发布会上，突然开始了LBX的暴动，谜的组织《探测者》发出了要用LBX像全世界宣战的布告，经历了阿尔忒弥斯与变革者事件成长了的世界冠军山野坂，为了阻止探测者的阴谋，拿起新机艾尔西昂与新的伙伴大空弘花咲兰再次开始了拯救世界的战斗

里见孝太郎（中村悠一配音）是一位看似再普通不过的高中生，居住在房租极为廉价的可乐娜庄公寓106号房间，过着平静的生活令孝太郎再也没有想到的是，在某一天，他波澜不惊的生活会因为一位少女的出现而彻底遭到改变少女名叫东本愿早苗（铃木惠理配音），她的真实身份竟然是寄宿在106号房间的幽灵，在企图吓跑孝太郎的计划失败后，早苗开始渐渐习…